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डॉ. मनोज प्रसाद स्टाफ वैज्ञानिक IV पीएच.डी.: कलकत्ता युनिवर्सिटी, पोस्टडॉक्टोरल फैलो:इंस्टिट्यूट फॉर प्लांट जेनेटिक्स एंड क्रॉप प्लांट रिसर्च (एवीएच फैलो), गैटेर्सलेबेन, जर्मनी दूरभाष: 91-11-26741612,14,17 एक्सटेंशन. - 160 सीधा संपर्क - 26735160 फैक्स: 91-11-26741658 ई मेल: manoj_prasad@nipgr.res.in; manoj_pds@yahoo.com; manojpds@hotmail.com वेबपेज:http://network.nature.com/people/UBC941DE5/profile |
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रुचि अनुसंधान |
| ट्रांसक्रिप्ट प्रोफाइलिंग ऑफ़ साल्ट एंड ड्राट स्ट्रेस इन फ़ॉक्सटेल मिलेट (Setaria italica (L.) BEAUV) एंड क्लोनिंग - कैरेकट्राईसेशन ऑफ़ स्ट्रेस रिलेटेड जीन्स |
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अजैविक पर्यावरण तनाव, मुख्य रूप से नमक और सूखे से तनाव संभावित उपज में कमी के सबसे महत्वपूर्ण कारण हैं| नमक में सुधार, फसलों में ठंडे और सूखे के सहिष्णुता को व्यक्त करना कठिन हैं क्योंकि आंशिक रूप से वे मात्रात्मक लक्षण हैं और मल्टीजेनिक प्रतिक्रियाओं का हिस्सा नमक एवं सूखा तनाव स्थितियों के तहत पता लगाने योग्य हैं| फसलों की नमक और सूखे के तनाव पर प्रतिक्रिया की जानकारी केवल कुछ नमक एवं सूखे से प्रेरित जीन के सजेस्टेड फ़ंक्शन के साथ वर्णनात्मक रही है|
फ़ॉक्सटेल मिलेट (कागनी) (अपने सूखे के प्रति सहिष्णुता के लिए जाना जाता है) दुनिया के सबसे पुराने कलटिवेटेड फसलों में से है और और अभी भी भारत के अर्ध - शुष्क क्षेत्रों में लोगों के बड़े वर्ग के लिए मुख्य भोजन हैं| फ़ॉक्सटेल मिलेट (कागनी), मिलेट(कागनी) की कुल विश्व उत्पादन में दूसरी रैंक में आता है और यह दुनिया के लाखों लोगों के लिए छह मिलियन टन भोजन प्रदान कर कृषि के क्षेत्र में एक महत्वपूर्ण स्थान पर हैं, मुख्य रूप से दक्षिणी यूरोप की गरीब या सीमांत मिट्टी पर और शीतोष्ण, उप- उष्णकटिबंधीय और उष्णकटिबंधीय एशिया में जहां मानसून की विफलता और सूखा होते रहते हैं और भूमि भूभाग मुश्किल है| ये क्षेत्र जनसंख्या वाले देशों में अक्सर गरीबी और बारंबार भुखमरी के हॉट स्पॉट हैं| फ़ॉक्सटेल मिलेट(कागनी) एक स्वयं-परागण फसल (2n = 2x = 18) के साथ एक अगुणित परमाणु डीएनए सामग्री अनुमानित 0.82 pg हैं| छोटा जीनोम आकार (चावल के समान), रिपीटिटिव डीएनए के कम अनुपात (30%), एक उच्च पिघल बिंदु घटक की उपस्थिति (जीनोम के 4.7-6.7% विशिष्ट वातावरण के लिए जीनोमिक रूपांतरों में एक कार्यात्मक भूमिका है) और फ़ॉक्सटेल मिलेट(कागनी) की द्विगुणित प्रकृति ने इसे आनुवंशिक और आणविक अध्ययन के लिए एक उपयुक्त जीव बना दिया है| हालांकि, फसल प्रादेशिक महत्व का एक छोटा सा अनाज माना जाता है, अन्य स्टेपल अनाज के आनुवंशिक और आणविक स्तर पर अध्ययन पीछे है| हमारी प्रयोगशाला के उद्देश्य हैं:-
1) क्लोनिंग एंड कैरेकट्राईसेशन ऑफ़ स्ट्रेस रिलेटेड ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर्स (e.g. DREB) फ्रॉम फ़ॉक्सटेल मिलेट 2) कमपैरीसन ऑफ़ ट्रांसक्रिप्ट एक्युमुलेशन इन साल्ट एंड ड्राट रेसिसटेंट एंड ससेप्तिब्ल प्लांट्स अपोन साल्ट एंड ड्राट स्ट्रेस इन फ़ॉक्सटेल मिलेट
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| प्रयोगशाला में अध्ययन के अन्य क्षेत्र इस प्रकार हैं: |
| ऐसोसीएशन मैपिंग ऑफ़ एग्रोनोमिक ट्रेट्स एंड एबायोटिक स्ट्रेस यूसिंग डीएनए-बेस्ड मार्कर्स इन फ़ॉक्सटेल मिलेट (Setaria italica (L.) BEAUV) |
ज्यादातर प्लांट प्रजनकों के रुचि के प्ररूपी लक्षण मात्रात्मक रूप से विरासत में मिले हैं| QTL मानचित्रण प्ररूपी लक्षण को अप्रत्यक्ष रूप से चयन की संभावना प्रदान करता है, जिसके लिए डीएनए आधारित मार्करों का उपयोग करते हैं, लेकिन यह विधि बहुत समय लेती है और कुछ ही फसलों के लिए सीमित है| इस विधि में बाई-पेरेंट मानचित्रण जनसंख्या की आवश्यकता होती है जिसके उत्पादन में बहुत समय लगता है| यह मानचित्रण जनसंख्या एक उच्च संकल्प की QTL मानचित्रण प्रदान नहीं करता है क्योंकि इसके निर्माण के समय केवल कुछ ही क्रोस ओवर /रीकोम्बीनेशन इवेंट्स होते हैं| एक बड़ी संख्या में क्रोस ओवर इवेंट्स की आवश्यकता एक उच्च रिज़ॉल्यूशन के QTL नक्शे में होती है| यह केवल एक प्राकृतिक जनसंख्या में पाया जा सकता है| यह विधि जो QTL मानचित्रण के लिए एक प्राकृतिक आबादी का उपयोग करता है एसोसिएशन मानचित्रण है| इस विधि ह्यूमन जेनेटिक्स में रोग प्रतिरोधिता के जीन की पहचान के लिए बहुत सफल रही है| यह विधि अब एसोसिएशन मानचित्रण आँकड़ों में प्रगति के कारण, प्लांट में इस्तेमाल किया जा रहा है| एसोसिएशन मानचित्रण एक जीन / QTL और एक प्ररूपी विशेषता के बीच एक महत्वपूर्ण एसोसिएशन स्थापित करने की एक सांख्यिकीय दृष्टिकोण है| इस अध्ययन के तीन उद्देश्य हैं:- 1 - टू डीटेक्ट एनी पोपुलेशन स्ट्रकचर इफ इट इस प्रेसेंट इन फ़ॉक्सटेल नेचुरल पोपुलेशन 2 - एस्टीमेशन ऑफ़ लेवल एंड एक्सटेंट ऑफ़ लिंकेज डिसईक्वीलिब्रियम (LD) इन फ़ॉक्सटेल मिलेट 3 - ऐसोसीएशन मैपिंग बाई यूसिंग पोपुलेशन स्ट्रकचर, डीएनए- बेस्ड मार्कर्स एंड फेनोटाईपिक डेटा
इस प्रयास के परिणाम से फ़ॉक्सटेल मिलेट प्रजनन और आनुवंशिकी के लंबी रेंज के लक्ष्यों को पाने में सुविधा होगी: (a) ऍन अंडरस्टैंडिंग ऑफ़ द मार्कर-ट्रेट रीलेशंशिप्स फॉर इम्पौरटेंट ट्रेट्स इन इंडियन फ़ॉक्सटेल ब्रीडिंग प्रोग्राम्स (b) ऐ कैरेकट्राईसेशन ऑफ़ द जेनेटिक डाईवर्सिटी इन द इंडियन फ़ॉक्सटेल ब्रीडिंग प्रोग्राम्स (c) लिंकेज डिसईक्वीलिब्रियम एस्टिमेट्स इन फ़ॉक्सटेल मिलेट (d) जर्मप्लास्म एक्सचेंज बिटवीन ब्रीडिंग प्रोग्राम्स
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मोलेकुलर मैपिंग ऑफ़ टोमेटो लीफ कर्ल वाइरस (ToLCV) रेसिस्टेंस जीन्स इन टोमेटो
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टोमेटो लीफ कर्ल बीमारी जिसका मुख्य कारण whitefly वहन टोमेटो लीफ कर्ल वाइरस के परिवार geminiviridae हैं, एक प्रमुख वायरल बीमारी का कारण है जो दक्षिण भारत और उत्तर भारत में शरद ऋतु और गर्मियों के दौरान 90% से अधिक पैदावार नुकसान का कारण होता हैं| विभिन्न प्रजनन समूहों ने जो इस समस्या पर कार्य कर रहे हैं कुछ प्रतिरोध की जंगली स्रोतों की पहचान की है और उन्हें कलटिवेटेड प्रजातियों में हस्तांतरित किया है जिससे की वांछनीय बागवानी लक्षण के साथ प्रतिरोधक क्षमता की किस्मों का विकास हो|
दक्षिण और उत्तर भारत वायरस के विभिन्न प्रकारों के अस्तित्व की पृष्ठभूमि है और वायरस के विकास के लिए उच्च संभावित क्षेत्र हैं, यह महत्वपूर्ण है कि सभी उपलब्ध प्रतिरोध स्रोतों का उपयोग कर एक मजबूत और टिकाऊ प्रतिरोध शक्ति बनाई जाये| जीन्स से जुड़ा आणविक मार्करों का उपयोग प्रतिरोध के लिए एक उपकरण है,जो मात्रात्मक प्रतिरोध की अप्रत्यक्ष रूप से चयन के लिए प्लांट प्रजनन में कुशलता से इस्तेमाल किया जा सकता है तथा विभिन्न स्रोतों से एक एकल cultivar में प्रतिरोध के त्वरित हस्तांतरण के लिए भी किया जा सकता है| इसलिए मैपिंग करना तथा उपलब्ध प्रतिरोध जीनों से जुड़े ब्रीडर अनुकूल मार्करों को ढूंढना आवश्यक है| सप्रेशन सबट्रैकटिव हाईब्रीडाईजेशन टेक्निक (SSH) का प्रयोग करके हमने एक प्रतिरोधी और अतिसंवेदनशील cultivar के बीच 37 महत्वपूर्ण विभिन्न प्रकार से व्यक्त जीनों की पहचान की है| जीनों के लक्षण-वर्णन का काम चल रहा हैं|
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करियर |
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स्टाफ वैज्ञानिक IV, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2008-वर्तमान) |
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स्टाफ वैज्ञानिक III, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2004-2008) |
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पोस्ट डॉक्टरल फैलो, इंस्टिट्यूट फॉर प्लांट जेनेटिक्स एंड क्रॉप प्लांट रिसर्च, गैटेर्सलेबेन, जर्मनी (2000-2003) |
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रिसर्च एसोसिएट, चौधरी. चरण सिंह विश्वविद्यालय, मेरठ (1998-2000) |
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पुरस्कार |
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पोस्ट डॉक्टरल फैलोशिप से सम्मानित (बी.एम.बी.एफ) गेबी, जर्मनी (2002-03) |
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डिज्नी कॉरनैडो स्प्रिंग्स रिज़ॉर्ट में आयोजित 10व़ी आईएपीटीसी एंड बी / एसआईवीबी कांग्रेस में भाग लेने के लिए फैलोशिप से सम्मानित, फ्लोरिडा, अमरीका (जून 23-28, 2002) |
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अलेक्जेंडर वॉन हम्बोल्ट फैलोशिप से सम्मानित - एवीएच फाउन्डेशन, बॉन, जर्मनी (2000-01) |
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| राष्ट्रीय |
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प्लांट विज्ञान में प्रो. हीरा लाल चक्रवर्ती मेमोरियल पुरस्कार से सम्मानित - (आईएससीए) भारतीय विज्ञान कांग्रेस एसोसिएशन द्वारा (2011) |
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मेम्बेर्स ऑफ़ नेशनल अकैडमी ऑफ़ साइंसेस, इंडिया |
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जैव प्रौद्योगिकी के विभाग द्वारा बायोटेक्नोलॉजी ओवरसीस एसोसिएटशिप से सम्मानित - गवर्नमेंट ऑफ़ इंडिया (2006-2007)
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कृषि विज्ञान राष्ट्रीय अकैडमी द्वारा "एनएएएस एसोसिएट" (एनएएएस) से सम्मानित , नई दिल्ली, भारत |
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कृषि विज्ञान राष्ट्रीय अकादमी (एनएएएस) द्वारा "द्विवार्षिकी युवा वैज्ञानिक" से सम्मानित, फसल विज्ञान में उत्कृष्ट योगदान के लिए (2003-2004) इस पुरस्कार में एक प्रशस्ति पत्र, एक पदक और नकद पुरस्कार. रु.25,000 / - था| |
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विज्ञान एवं प्रौद्योगिकी विभाग द्वारा युवा वैज्ञानिक फैलोशिप से सम्मानित, गवर्नमेंट ऑफ़ इंडिया (2004) |
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Research poster entitled "Physical mapping of microsatellite markers on wheat chromosome arms 2DL, 6BS and 7DL carrying loci for grain protein content and pre-harvest sprouting tolerance" was appreciated widely and got the best poster award at 4th ADNAT symposium on DNA Technologies in the Management of Biodiversity held at M. S. Swaminathan Research Fundation, Chennai during February 20-21, 2000. |
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गवर्नमेंट ऑफ़ इंडिया द्वारा राष्ट्रीय योग्यता छात्रवृत्ति से सम्मानित (1992-1994) |
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रामकृष्ण मिशन विवेकानंद सैनेटेनरी कॉलेज (कलकत्ता विश्वविद्यालय) द्वारा "पदक और सम्मान के प्रमाण पत्र से सम्मानित, गवर्नमेंट ऑफ़ इंडिया (1992-1994)
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समूह के सदस्य
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चयनित प्रकाशन |
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Puranik S and Prasad M (2011) Role of NACs in regulation of abiotic stress responses in plants. In: Goyal A & Maheshwari P (ed) Current Advances In Plant Science, Bentham Science Publisher, USA (In press). |
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Lata C and Prasad M (2011) Role of DREBs in regulation of abiotic stress responses in plants. Journal of Experimental Botany. (DOI: 10.1093/jxb/err210). |
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Lata C, Yadav A and Prasad M (2011) Role of transcription factors in abiotic stress tolerance. In: Shanker A (ed.) Abiotic Stress/Book2, INTECH Open Access Publishers, Rijeka, Croatia, ISBN 979-953-307-195-3; 2011 (in press) |
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Puranik S, Kumar K, Srivastava PS and Prasad M (2011) Electrophoretic Mobility Shift Assay reveals a novel recognition sequence for Setaria italica NAC protein. Plant Signaling and Behavior. (Accepted) |
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Dwivedi S, Upadhyaya H, Senthilvel S, Hash C, Fukunaga K, Diao X, Santra D, Baltensperger D, Prasad M (2011) Millets: Genetic and Genomic Resources. Plant Breeding Reviews (In Press) |
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Prasad M (2011) Solanaceae conferance: A report on the 7th Solanaceae Conferance (SOL)held during 5-9 September 2010 at Dundee, Scotland. Current Science 100(5): 610-612. Read... |
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Gupta S, Kumari K, Das J, Lata C, Puranik S and Prasad M (2011) Development and utilization of novel intron length polymorphic markers in foxtail millet [Setaria italica (L.) P. Beauv.]. Genome (doi/abs/10.1139/g11-020). |
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Puranik S, Bahadur RP, Srivastava PS, and Prasad M (2011)Molecular cloning and characterization of a membrane associated NAC family gene, SiNAC from foxtail millet [Setaria italica (L.) P. Beauv.]. Molecular Biotechnology (DOI: 10.1007/s12033-011-9385-7). |
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Lata C, Bhutty S, Bahadur RP, Majee M and Prasad M (2011) Association of SNP in a novel DREB2-like gene SiDREB2 with stress tolerance in foxtail millet [Setaria italica (L.)]. Journal of Experimental Botany (DOI: 10.1093/jxb/err016). |
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Lata C, Jha S, Dixit V, Sreenivasulu N and Prasad M (2011)Differential antioxidative responses to dehydration-induced oxidative stress in core set of foxtail millet cultivars [Setaria italica (L.)]. Protoplasma (DOI:10.1007/s00709-010-0257-y). |
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Puranik S, Jha S, Srivastava PS, Sreenivasulu N, Prasad M (2011) Comparative transcriptome analysis of contrasting foxtail millet cultivars in response to short-term salinity stress. Journal of Plant Physiology 168: 280-287. (doi:10.1016/j.jplph.2010.07.005) |
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Sahu PP, Rai NK, Chakraborty S, Singh M, Prasanna HC, Ramesh B, Chattopadhyay, D and Prasad M (2010) Tomato cultivar tolerant to Tomato leaf curl New Delhi virus infection induces virus-specific siRNA accumulation and defense associated host gene expression. Molecular Plant Pathology 11(4): 531-544 (doi:10.1111/J.1364-3703.2010.00630-x). |
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Chandna R*, Gupta S*, Ahmad A, Iqbal M and Prasad M (2010) Variability in Indian bread wheat (Triticum aestivum L.) varieties differing in Nitrogen efficiency as assessed by microsatellite markers. Protoplasma 242: 55-67 (doi:10.1007/s00709-010-0122-z) *Authors contributed equally. |
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Lata C, Sahu PP, and Prasad M (2010) Comparative transcriptome analysis of differentially expressed genes in foxtail millet (Setaria italica L.) during dehydration stress. Biochem. Biophys. Res. Comm. 393: 720-727. |
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Gupta S and Prasad M (2009) Development and characterization of genic SSR-markers in Medicago trancatula and its transferability in leguminous and non-leguminous species. Genome 52: 761-771. |
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Mohan A, Kulwal P, Singh R, Kumar V, Mir RR, Kumar J, Prasad M, Balyan HS and Gupta PK (2009) Genome-wide QTL analysis for pre-harvest sprouting tolerance in bread wheat. Euphytica 168: 319-329. |
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Sharma K, Agrawal V, Gupta S, Kumar R and Prasad M (2008) ISSR marker-assisted selection of male and female plants in a promising dioecious crop: jojoba (Simmondsia chinensis). Plant Biotech. Report 2: 239-243. |
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Jayaraman A, Puranik S, Rai NK,Vidapu S, Sahu PP, Lata C and Prasad M (2008) cDNA-AFLP analysis reveals differential gene expression in response to salt stress in foxtail millet (Setaria italica L.). Molecular Biotechnology. 40: 241-251. |
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Kota R, Varshney RK, Prasad M, Zhang H, Stein N and Graner A (2008) EST-derived single nucleotide polymorphism markers for assembling genetic and physical map of the barley genome. Funct & Integ Genomics 8: 223-233. |
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Stein N*, Prasad M*, Scholz U, Thiel T, Zhang H, Wolf M, Kota R, Varshney RK, Perovich D, Grosse I and Graner A (2007) A 1000 loci transcript map of the barley genome new anchoring points for integrative grass genomics. Theor. Appl. Genet. 114: 823-839. * Authors contributed equally. |
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Gupta S, Pandey-Rai S, Srivastava S, Naithani SC, Prasad M and Kumar S (2007) Construction of primary genetic linkage map of the medicinal-cum-ornamental plant Catharanthus roseus. J of Genetics 86: 259-268. |
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Zhao T, Palotta M, Langridge P, Prasad M, Graner A, Schulze-Lefert P and Koprek T (2006): Mapped Ds/T-DNA launch pads for functional genomics in barley. Plant J. 47: 811-826. |
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Varshney RK, Grosse I, Haehnel U, Siefken R, Prasad M, Stein N, Langridge P, Altschmied L and Graner A (2006) Genetic mapping and BAC assignment of EST-derived SSR markers shows non-uniform distribution of genes in the barley genome. Theor Appl Genet. 113: 239-250. |
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Potokina E, Prasad M, Malysheva L, Roeder MS and Graner A (2006) Expression genetics and haplotype analysis reveal cis regulation of serine carboxypeptidese I (Cxp 1), a candidate gene for malting quality in barley (Hordeum vulgare L.). Funct & Integ Genomics 6(1): 25-35. |
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Potokina E, Caspers M, Prasad M, Kota R, Zhang H, Sreenivasulu N, Wang M and Graner A (2004) Functional association between malting quality trait components and cDNA array based expression patterns in barley (Hordeum vulgare L.). Molecular Breeding 14: 153-170. |
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Perovich D, Steins N, Zhang H, Drescher A, Prasad M, Kota R, Kopahnke D and Graner A (2004) An integrated approach for comparative mapping in rice and barley with special reference to the Rph16 resistance locus. Funct & Integ Genomics 4(2): 74-83. |
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Maucher H, Stenzel I, Miersch O, Stein N, Prasad M, Zierold U, Schweizer P, Dorer C, Hause B and Wasternack C (2004): The allene oxide cyclase of barley (Hordeum vulgare L.)- Cloning and organ-specific expression. Phytochemistry 65(7): 801-811. |
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Prasad M, Kumar N, Kulwal PL, Roeder MS, Balyan HS, Dhaliwal HS and Gupta PK (2003). QTL analysis for grain protein content using SSR markers and validation studies using NILs in bread wheat. Theor Appl Genet 106: 659-667. |
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Roy JK, Balyan HS, Prasad M and Gupta PK (2002) Use of SAMPL for a study of DNA polymorphism, genetic diversity and possible gene tagging in bread wheat. Theor Appl Genet 104: 465-472. |
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Harjit-Singh, Prasad M, Varshney RK, Roy JK, Balyan HS, Dhaliwal HS and Gupta PK (2001): STMS markers for grain protein content and their validation using near-isogenic lines in bread wheat. Plant Breeding 120: 273-278. |
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Prasad M, Varshney RK, Roy JK, Balyan HS and Gupta PK (2000) The use of microsatellites for detecting DNA polymorphism, genotype identification and genetic diversity in wheat. Theor Appl Genet 100: 584-592. |
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Varshney RK, Prasad M, Kumar N, Balyan HS, Roy JK and Gupta PK (2000) Identification of eight chromosomes and a microsatellite marker on 1AS associated with QTL for grain weight in bread wheat. Theor Appl Genet 100: 1290-1294. |
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Prasad M, Varshney RK, Kumar A, Balyan HS, Sharma PC, Edwards KJ, Singh H, Dhaliwal HS, Roy JK and Gupta PK (1999) A microsatellite marker associated with a QTL for grain protein content on chromosome arm 2DL of bread wheat. Theor Appl Genet 99: 341-345. |
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Roy JK, Prasad M, Varshney RK, Balyan HS, Blake TK, Dhaliwal HS, Singh H, Edwards KJ and Gupta PK (1999) Identification of a microsatellite on chromosome 6B and a STS on 7D of bread wheat showing association with pre-harvest sprouting tolerance. Theor Appl Genet 99: 336-340. |
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Kumar S and Prasad M (2007) Crop breeding prospects in the genomics era. J of New Seeds 8(3): 29-49. |
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Gupta PK, Roy JK and Prasad M (2001) Single nucleotide polymorphisms (SNPs): a new paradigm in molecular marker technology and DNA polymorphism detection with emphasis on their use in plants. Current Science 80(4): 524-535. |
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Prasad M and Chaudhuri RK (2000) Genome organization, Molecular markers and Linkage maps of rice. J Natl Bot Soc 54: 114-125. |
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Gupta PK, Roy JK and Prasad M (1999) DNA chips, microarrays and genomics. Current Science 77(7): 875-884. |
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Gupta S, Ghose TK, Jaiswal JP & Prasad M (2011) Molecular marker systems and compilation of genetic linkage maps of cultivated plants. In: Kumar A, Arora S, Ambwani S (eds), "Biotechnology in Medicine and Agriculture: Principles and Practices". IK International Publishers, New Delhi (in press) |
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Varshney RK, Prasad M and Graner A (2004) Molecular Marker maps of barley: a resource for intra-and interspecific genomics. In: Lrz H. and Wenzel G. (eds), "Molecular Markers in Plant Breeding and Crop Improvement" Springer-Verlag Publishers, Germany pp 229-239 |
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Gupta PK, Varshney RK and Prasad M (2002) Molecular Markers: Principles and methodology. In: Jain SM, Ahloowalia BS and Brar DS (eds), "Molecular Techniques in Crop Improvement" Kluwer Academic Publishers, Netherlands pp 9-54. |
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