डॉ. निरंजन चक्रवर्ती
    एफ एन एएससी., स्टाफ वैज्ञानिक VI
    जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय:पीएच.डी. , नई दिल्ली
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 अनुसंधान क्षेत्र
अनुसंधान कार्यक्रम आणविक (ओं) की अंतर्निहित प्लांट अबायोटिक स्ट्रेस के लिए प्रतिक्रिया तंत्र की व्याख्या पर केंद्रित है, जो फिजियो रासायनिक, प्रोटिओमिक्स, और जीनोमिक्स दृष्टिकोण का संयोजन का उपयोग कर होती हैं| यह इस कैंडीडेट जीन और जीन उत्पादों की पहचान गाइड है और उनके इस तरह के तनाव में सुधार अनुकूलन की ओर लक्षित हेरफेर के लिए नीति के लिए आधार माना जाएगा| मेरी प्रयोगशाला की एक अन्य शोध रुचि फसल में पोषक तत्वों की गुणवत्ता में सुधार है|
स्ट्रेस जीनोमिक्स
यह स्पष्ट है कि sessile के  कारण पौधों ने  कई पर्यावरण  तनावों में  प्रतिक्रिया  के लिए , विभिन्न रूपांतरों में विकसित किया है | हमारा उद्देश्य आणविक सेलुलर प्रतिक्रिया में इस तरह के स्ट्रेसेस का संचालन निर्धारित करना है| प्रोटीन संश्लेषण या गिरावट परिवर्तन का एक मौलिक चयापचय (मेटाबोलिक प्रोसेस) की प्रक्रिया है जो कि तनाव सहिष्णुता को प्रभावित कर सकते हैं| हम हाई थ्रौपुट प्रोटमिक्स अप्प्रोचेस विकसित कर रहे हैं, जिससे की पौंधे की विभिन्न पर्यावरण तनाव, संकेत ट्रांसडक्सन, और चयापचय प्रतिक्रियाओं का अध्ययन हो सके| हम सबसेलुलर प्रोटिओमिक्स पर ध्यान केंद्रित कर रहे हैं जिसमे प्रोटियोम खनन उपकरणों के एक नंबर का उपयोग कर के क्रम में तनाव की शर्तों के तहत प्रोटीन संशोधनों और / या उनके अंतर अभिव्यक्ति की भूमिका को को समझ सकें | तुलनात्मक प्रोटिओमिक विश्लेषण key   regulatory   प्रोटीन की  पहचान में सक्षम होगा , जो कि  विविध, जटिल और तनाव में गतिशील नेटवर्क के संचालन में  बहुमूल्य अंतर्दृष्टि प्रदान करेगा | प्रमुख ध्यान केन्द्रित है stress-responsive proteins (एस आर पी एस) की गतिशीलता की पहचान करने के लिए नियामक जीन की खोज पर नियंत्रण तनाव सहिष्णुता और ट्रांसजेनिक पौधों में उनकी हेरफेर होगा|
पोषण जीनोमिक्स
हमारे हित के अन्य क्षेत्र में गुणवत्ता के लक्षण शुरू करने से फसल पौधों के पोषण की गुणवत्ता में सुधार है| सूक्ष्म पोषक और आहार प्रोटीन के महत्व को ध्यान में रखते हुए, और यह तथ्य है कि पौधे उनके प्रमुख स्रोत हैं, मूल्य वर्धित ट्रांसजेनिक फसलों की विकास हमारी प्राथमिकता है| हाल के वर्षों के दौरान, हम आलू की पोषक गुणवत्ता बढ़ाने में सफल रहे हैं. वर्तमान में, हम कुछ अन्य नए जीन उपयोग कर रहे हैं जिससे की खाद्य फसलों में सूक्ष्म तत्व की जैव उपलब्धता में सुधार होगा| हमने पोषण को बढ़ाने की दिशा में एक कदम के रूप में कार्बोहाइड्रेट युक्त, गैर पारंपरिक प्रधान फसलों के कई आनुवंशिक परिवर्तन के लिए कुशल प्रौद्योगिकी का विकास किया है|
 चयनित प्रकाशन
Chattopadhyay A, Subba P, Pandey A, Bhushan D, Kumar R, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2011) Analysis of the grasspea proteome and identification of stress-responsive proteins upon exposure to high salinity, low temperature and abscisic acid treatment. Phytochemistry 72: 1293-1307.
Bhushan D, Jaiswal DK, Ray D, Basu D, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2011) Dehydration-responsive reversible and irreversible changes in the extracellular matrix: comparative proteomics of chickpea genotypes with contrasting tolerance. J. Proteome Res. 10: 2027-2046.
Ghosh S, Meli VS, Kumar A, Thakur A, Chakraborty N, Chakraborty S and Datta A (2011) The N-glycan processing enzymes α-mannosidase and β-D-N-acetylhexosaminidase are involved in ripening-associated softening in the non-climacteric fruits of capsicum. J. Exp. Bot. 62: 571-582.
Chakraborty S, Chakraborty N, Agrawal L, Ghosh S, Narula K, Shekhar S, Naik PS, Pande PC, Chakraborti SK and Datta A (2010) Next-generation protein-rich potato expressing the seed protein gene AmA1 is a result of proteome rebalancing in transgenic tuber. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 17533-17538.
Agrawal GK, Bourguignon J, Rolland N, Ephritikhine G, Ferro M, Jaquinod M, Alexiou KG, Chardot T, Chakraborty N, Jolivet P, Doonan JH and Rakwal R (2010) Plant organelle proteomics: Collaborating for optimal cell function. Mass Spectrom. Rev. PMID 21038434.
Pandey A, Rajamani U, Verma J, Subba P, Chakraborty N, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2010) Identification of extracellular matrix proteins of rice (Oryza sativa L.) involved in dehydration-responsive network: a proteomic approach. J. Proteome Res. (in press).
Meli VS, Ghosh S, Prabha TN, Chakraborty N, Chakraborty S and Datta A (2010) Enhancement of fruit shelf life by suppressing N-glycan processing enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 2413-2418.
Ashraf N, Ghai D, Barman P, Basu S, Nagaraju G, Mondol MK, Chakraborty N, Datta A and Chakraborty S (2009) Comparative analyses of genotype-dependent expressed sequence tags and stress-responsive transcriptome of chickpea wilt illustrates predicted and unexpected genes and novel regulators of plant immunity. BMC Genomics 10: 415.
Chaudhary MK, Basu D, Datta A, Chakraborty N and Chakraborty S (2009) Dehydration-responsive nuclear proteome of rice (Oryza sativa L.) illustrates protein network, novel regulators of cellular adaptation and evolutionary perspective. Mol. Cell. Proteomics 8: 1579-1598.
Agrawal L, Chakraborty S, Jaiswal DK, Gupta S, Datta A and Chakraborty N (2008) Comparative proteomics of tuber induction, development and maturation reveal the complexity of tuberization process in potato (Solanum tuberosum L.) J. Proteome Res. 7: 3803-3817.
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Bhushan D, Pandey A, Choudhary MK, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2007) Comparative proteomics analysis of differentially expressed proteins in chickpea extracellular matrix during dehydration stress. Mol. Cell. Prot. 6: 1868 -1884.
Pandey A, Choudhary MK, Bhushan D, Chattopadhyay A, Chakraborty S, Datta A and Chakraborty N (2006) The nuclear proteome of chickpea (Cicer arietinum L.) reveals predicted and unexpected proteins. J. Proteome Res. 5: 3301-3311.
Chakraborty N, Ohta MO and Zhu JK (2006) Recognition of a PP2C interaction motif in several plant protein kinases. Methods in Molecular Biology. 365: 287-298.
Bhushan D, Pandey A, Chattopadhyay A, Choudhary MK, Chakraborty S, Datta A and Chakraborty N (2006) Extracellular matrix proteome of chickpea (Cicer arietinum) illustrates pathway abundance, novel protein functions and evolutionary perspect. J. Proteome Res. 5: 1711-1720.
Chakraborty S, Chakraborty N, Jain D, Salunke DM and Datta A (2002). Active site geometry of oxalate decarboxylase from Flammulina velutipes: Role of histidine coordinated manganese in substrate recognition. Protein Sci. 11: 2138-2147.
Chakraborty S, Sarmah B, Chakraborty N and Datta A (2002) Premature termination of RNA polymerase II mediated transcription of a seed protein gene in Schizosaccharomyces pombe. Nuclei Acids. Res. 30: 2940-2949.
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Chakarborty S, Chakarborty N and Datta A (2000). Increased nutritive value of transgenic potato by exspressing a nonallergenic seed albumin gene from Amaranthus hypochondriacus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97: 3724-3729.
Chakarborty N and Tripathy BC (1992) Involvement of singlet oxygen in 5-aminolevulinic acid induced photodynamic damage of cucumber (Cucumis sativus L.) chloroplasts. Plant Physiol. 98: 7-11.
Tripathy BC and Chakraborty N (1991) 5- aminolevulinic acid induced photodynamic damage to the photosynthetic electron transport chain of cucumber (Cucumis sativus L.) cothledons. Plant Physiol. 96: 761-767.