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डॉ. सभ्यता भाटिया स्टाफ वैज्ञानिक V दूरभाष: 91-11-26741612,14,17 एक्सटेंशन. - 159 सीधा संपर्क - 26735159 ई मेल: sabhyata_bhatia@nipgr.res.in; sabhyatab@yahoo.com |
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अनुसंधान क्षेत्र |
मोलेकुलर मैपिंग एंड जेनोमिक्स ऑफ़ चिकपी एंड कैथारैन्थस रोजेज
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हाल ही में आण्विक जीव विज्ञान में सबसे महत्वपूर्ण विकास प्राकृतिक डीएनए सीक्वेंस बहुरूपता का पता लगाना और उसकी उपयोगिता है| इस संदर्भ में, आणविक मार्कर आनुवंशिक विविधता परख करने की प्रक्रिया के लिए आदर्श उपकरण हैं| इन वर्षों में आणविक मार्करों के प्रकार में अभूतपूर्व वृद्धि हुई है, जो शोधकर्ता के विभिन्न आवश्यकताओं को पूरा करती हैं | आखिरकार, आणविक तकनीको को अनगिनत संख्या में विकसित किया गया है, जो बहुतायत, बहुरूपता, विशिष्टता, और पुन:उत्पादन के स्तर पर, अलग-अलग होते हैं| आनुवंशिक लिंकेज मैप के निर्माण के लिए आण्विक मार्कर कुशल और शक्तिशाली उपकरण हैं, साथ ही जीन की पहचान, महत्वपूर्ण लक्षण की टैगिंग और मार्कर असिस्टेड सेलेक्शन के लिए भी होता हैं| इसके अतिरिक्त, डीएनए मार्कर जीनोम विश्लेषण और प्लांट व्यवस्था में नए अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं, इसके अतिरिक्त जर्मप्लाज्म लक्षण, वंशावली विश्लेषण, विकासवादी अध्ययन और आनुवंशिक निदान में भी मदद करते हैं| आजकल, असंख्य मार्कर सिस्टम है जैसे कि क्लासिकल RFLP एवं RAPD, AFLP और STMs और तकनीकी रूप से उन्नत SNPs उपलब्ध हैं| अलग-अलग आणविक मार्करों के बीच, हमारी प्रयोगशाला में जेनोमिक एवं कोडिंग रीजन्स के माइक्रोसेटेलाइट मार्करों के विकास पर शोध किया गया है, जो कि दो महत्वपूर्ण फसलों Cicer arietinum (सामान्यतः चना के रूप में जाना जाता है) जो तीसरा सबसे महत्वपूर्ण दहलन फसल है, और Catharanthus roseus एक औषधीय प्लांट हैं जो कि अपनी एंटी-कैनसरस गुणवत्ता के लिए जाना जाता हैं|
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हमारी प्रयोगशाला में डीएनए आधारित आणविक मार्कर का उपयोग करते हुए, आणविक मानचित्रण पर ध्यान केंद्रित किया गया है, इसलिए नए STMs मार्कर (सीक्वेंस्ड टैग्ड माइक्रोसेटेलाइट साइटें) और EST आधारित SSR (सिम्पल सीक्वेंस रीपीट्स), SNP (एकल nucleotide बहुरूपता), PIP (संभावित Intron बहुरूपता) आदि का विकास पारंपरिक, समृद्ध और सीडीएनए लाइब्रेरी के निर्माण के माध्यम से कर रहे हैं| इन मार्करों के निहितार्थ (STMs और ESTs) एवं उनकी आनुवंशिक विविधता के अध्ययन के लिए अपनी क्षमता का अंतर और अंतर विशिष्ट स्तर पर उपर्युक्त फसलों का अध्ययन कर रहे हैं| आणविक स्तर पर, माइक्रोसेटेलाइट विकास के पैटर्न को सुलझाया गया है और साथ ही में नए फाईलोजेनेटिक रीलेशंशिप्स को स्पष्ट किया गया है| संबंधित पीढ़ी के बीच सिंटनी अध्ययन कराये जाते हैं ताकि उपर्युक्त मार्करों की उपयोगिता तुलनात्मक जीनोमिक्स के लिए स्थापित की जा सके| इंट्रा एवं इंटर-स्पेसिफिक मैपिंग पोपुलेशंस का उपयोग कर माइक्रोसेटेलाइट आधारित जेनेटिक लिंकेज मैप का निर्माण, लिंकेज मैप संतृप्ति के लिए और अग्रोनोमिकली महत्वपूर्ण लक्षण की टैगिंग के लिए प्रगति पर हैं| हाल ही में, चना से ESTs के बड़े पैमाने के उत्पादन पर जीनोमिक्स काम पर ध्यान केंद्रित करते हुए विशिष्ट ऊतकों से जैसे कि कार्यात्मक मार्कर्स के विकास के लिए बीज और नोड्युल्स चना में एक प्रतिलेख नक्शे के निर्माण के लिए काम चल रहा हैं|
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चयनित प्रकाशन |
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Choudhary S, Sethy NK, Shokeen B and Bhatia S (2009) Development of chickpea EST-SSR markers and analysis of allelic variation across related species. Theor. Appl. Genet. 118: 591-608. |
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Shokeen B, Sethy NK, Kumar S and Bhatia S (2007) Isolation and characterization of microsatellite markers for analysis of molecular variation in the medicinal plant Madagascar periwinkle (Catharanthus roseus (L.) G. Don.). Plant Science 172: 441-451. |
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Sethy NK, Shokeen B, Edwards KJ and Bhatia S (2006) Development of microsatellite markers and analysis of intra-specific genetic variability in chickpea (Cicer arietinum L.). Theor. Appl. Genet. 112: 1416-1428. |
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Sethy NK, Choudhary S, Shokeen B and Bhatia S (2006) Identification of microsatellite markers from Cicer reticulatum: Molecular variation and phylogenetic analysis. Theor. Appl. Genet. 112: 347-357 |
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Choudhary S, Sethy NK, Shokeen B and Bhatia S (2006) Development of sequence-tagged microsatellite site markers for chickpea (Cicer arietinum L.). Molecular Ecology Notes 6(1): 93-95. |
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Shokeen B, Sethy NK, Choudhary S and Bhatia S (2005) Development of STMS markers from the medicinal plant Madagascar periwinkle (Catharanthus roseus (L.) G. Don.). Mol. Ecol. Notes 5: 818-820. |
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Sethy N. K, Shokeen B and Bhatia S (2003) Isolation and characterization of sequence-tagged microsatellite sites markers in chickpea (Cicer arietinum L.). Mol. Ecol. Notes 3: 428-430. |
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Rajagopal J, Bashyam L, Bhatia S, Khurana DK, Srivastava PS and Lakshmikumaran M (2000) Evaluation of genetic diversity in the Himalayan Poplar using RAPD markers. Silvae Genetica 49(2): 60-66 |
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Singh A, Negi MS, Rajagopal J, Bhatia S, Tomar UK, Srivastava PS and Lakshmikumaran M (1999) Assessment of genetic diversity in Azadirachta indica using AFLP markers. Theor Appl Genet. 99(1/2): 272-279 |
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Das S, Rajagopal J, Bhatia S, Srivastava PS and Lakshmikumaran M (1999). Assessment of genetic variation within Brassica campestris cultivars using AFLP and RAPD markers. J. of Biosciences 24(4): 433-440 |
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Bhatia S, Negi MS and Lakshmikumaran M (1996) Structural Analysis of the rDNA Intergenic Spacer of Brassica nigra: Evolutionary Divergence of the Spacers of the Three Diploid Brassica Species. Journal of Molecular Evolution 43(5): 460-468. |
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Bhatia S, Das S, Jain A and Lakshmikumaran M (1995) DNA fingerprinting of Brassica juncea cultivars using microsatellite probes. Electrophoresis 16: 1750-1754. |
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Jain A, Bhatia S, Banga SS, Prakash S and Lakshmikumaran M (1994) Potential use of the random amplified polymorphic DNA (RAPD) to study the genetic diversity in Indian mustard (Brassica juncea) and its relationship to heterosis. Theoretical and Applied Genetics 88: 116-122. |
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Singh K, Bhatia S and Lakshmikumaran M (1994) Novel variants of the 5S rRNA genes in Eruca sativa. Genome 37: 121-128. |
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Bhatia S, Singh K, Jagannathan V and Lakshmikumaran M (1993) Organization and analysis of the 5S rRNA genes in B. campestris. Plant Science 92: 47-55. |
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पुस्तक अध्याय |
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Varshney RK, Hoisington DA, Upadhyaya HD, Gaur PM, Nigam SN, Saxena K, Vadez V, Sethy NK, Bhatia S, Aruna R, Gowda MVC, Singh NK (2007) Molecular genetics and breeding of grain legume crops for the semi-arid tropics. In Springer publication: Genomic Assisted Crop Improvement: Vol 2: Genomics Applications in Crops; R. Varshney and R. Tuberosa (eds.) pp. 207-241. |
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Lakshmikumaran M, Das S, Rajagopal J, Goswami J, Negi MS, Bhatia S (1998) Repeated DNA sequences in plants: Organization, Evolution and Applications. In Genetics and Biotechnology in Crop Improvement pp. 63-93. Rastogi Publications, Meerut, India; Editors: PK Gupta, SP Singh, HS Balyan, PC Sharma and B Ramesh |
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किताब |
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Lakshmikumaran M, and Bhatia S. 1996. DNA fingerprinting of medicinal plants : A means to preserve valuable genetic resources. RGICS Project No. 11. Rajiv Gandhi Institute for Contemporary Studies. Rajiv Gandhi Foundation, New Delhi. |
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