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डॉ. शुभ्रा चक्रवर्ती
पीएच.डी., एफ.एन.ए.एस.सी
स्टाफ वैज्ञानिक VI (प्रोफेसर)
पीएचडी, जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय
दूरभाष: 91-11-26735186
फैक्स: 91-11-26742658
ई मेल: schakraborty@nipgr.res.in, subhrac@hotmail.com |
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 करियर |
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स्टाफ वैज्ञानिक VI, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2011-वर्तमान) |
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स्टाफ वैज्ञानिक V, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2007-2011)
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स्टाफ वैज्ञानिक IV, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2003-2007) |
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स्टाफ वैज्ञानिक III,राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (2000-2003) |
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स्टाफ वैज्ञानिक II, राष्ट्रीय पादप जीनोम अनुसंधान संस्थान (1998-2000) |
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रिसर्च वैज्ञानिक, जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय (1997-1998) |
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| पुरस्कार और सम्मान |
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एन ऐ एस आई - रिलायंस इंडस्ट्रीस प्लैटिनम जुबिली अवार्ड(2010) |
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विसिटिंग साइंटिस्ट - येल यूनीवर्सिटी,यू. एस. ए. (2008) |
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डीबीटी प्रवासी एसोसिएटशिप, भारत सरकार, भारत (2007) |
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यंग वोमेन बायो साइंटिस्ट ऑफ़ प्रोमिस - आई.एस.सी. ए, भारत (2004) |
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राष्ट्रीय युवा महिला जैव वैज्ञानिक पुरस्कार, डीबीटी, भारत (2002) |
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प्रोफेसर हीरालाल चक्रवर्ती पुरस्कार, भारतीय विज्ञान कांग्रेस (2002) |
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टेक्नोलोजी डेवलपमेंट अवार्ड, डी बी टी - भारत सरकार, भारत (2000)
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आई.आर.आर.आई कोर रिसर्च फैलोशिप, आई.आर.आर.आई, फिलीपींस (1995) |
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युवा वैज्ञानिक पुरस्कार, आई.यू.बी.एम.बी (1994) |
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प्रोफेसर हीरालाल चक्रवर्ती पुरस्कार, राष्ट्रीय वानस्पतिक सोसायटी (1990) |
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फेलो, राष्ट्रीय विज्ञान अकादमी |
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सदस्य, सोसाइटी फॉर बायोलोजिकल केमिस्ट्स, भारत |
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भारत की प्रोटिओमिक सोसायटी |
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अमेरिकेन केमिकल सोसाइटी - यू. एस. ए. |
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| अनुसंधान |
| हमारे अनुसंधान तीन मुख्य क्षेत्रों में केंद्रित है: नियूट्रीशनल जीनोम, स्ट्रेस जीनोम और डिलेड फ्रूट सोफ्टनिंग| नियूट्रीशनल जीनोमिक्स में, हमारा उद्देश्य मनुष्य के स्वास्थ्य पोषण मुख्यतः प्लांट भोजन पर निर्भर करता है| प्रोटीन गुणवत्ता सुधार कार्यक्रम के भाग के रूप में हमने एक बीज अलब्यूमिन अमरैन्थस हाइपोकॉन्ड्रिकस और विकसित प्रोटीन युक्त ट्रांसजेनिक आलू से ए.एम.ए1 जीन क्लोन बनाया है| वर्तमान में, हमारी प्रयोगशाला ट्रांसजेनिक प्रोटीन की गुणवत्ता में सुधार के लिए इस नए जीन का उपयोग अनाज विकसित करने में कर रही है| वैकल्पिक रूप से, पोषकरोधी तत्व को हटाने के लिए, ऑक्सलेट विषाक्तता के रूप में गुर्दे से संबंधित बीमारियों में प्रमुख रूप में शामिल कारक पर हम ध्यान केंद्रित करते है| इस उद्देश्य के लिए, एक ऑक्सलेट निम्नीकृत एंजाइम, ऑक्सलेट डेकारबॉक्सिलेस का प्रयोग ऑक्सलेट ट्रांसजेनिक पौधों को विकसित करने में किया जा रहा है| इसके अलावा, हम सक्षम प्रौद्योगिकियों का विकास ऑक्सलेट युक्त फलों और सब्जियों को ऑक्सलेट डेकारबॉक्सिलेस के साथ बदलने के लिए कर रहे हैं| |
| हमारी दिलचस्पी का एक दूसरा क्षेत्र पौधों में कवक पैथोजेनेसिटी में विशेष जोर देने के साथ पौधों में स्ट्रेस जीनोमिक्स है| पौधे अक्सर विभिन्न जैविक तनाव का सामना करते हैं, जो कि उनके वृद्धि, विकास, और इससे भी महत्वपूर्ण संपूर्ण उत्पादकता को प्रभावित करते हैं| प्लांट सेल्स द्वारा अनुभव किए गए तनाव संकेत (स्ट्रेस सिग्नल्स) जीन की अभिव्यक्ति प्रोफाइल में बदलाव की ओर जाता है, जो कि बताता है कि प्लांट सेल्स किस तरह से उनपे (स्ट्रेस सिग्नल्स) काबू पाते हैं| ऑक्सालिक एसिड कई प्रकार की फसलों के पौधों में एक कवक (फंगल) पैथोजेनेसिटी में शक्तिशाली एलीसीटर है| हमने फंगल प्रतिरोधी ट्रांसजेनिक टमाटर पौधे को विकसित किया है, जो कि ऑक्सलेट डेकारबॉक्सिलेस को व्यक्त करता है| हमारी मौजूदा दिलचस्पी कवक सहिष्णुता (फंगल टोलेरंस) में ऑक्सलेट डेकारबॉक्सिलेस की भूमिका को सुलझाना है| इसके अतिरिक्त, हम फंगल विल्ट के जवाब में प्रतिरोधी जीन उम्मीदवारों (रेसिस्टेंट जीन कैंडीडेट्स) और पौधों की रक्षा प्रणाली की पहचान कर रहे हैं| हमारी प्रयोगशाला फ्यूजेरियम विल्ट के खिलाफ एक जीनोम फली की व्यापक ट्रान्सक्रिपटोम को चयापचय प्रतिक्रिया में स्ट्रेस पर्सेप्शन, विभेदक जीन अभिव्यक्ति और परिवर्तन के अध्ययन के लिए विकसित कर रही है| हमारा उद्देश्य विभिन्न व्यक्त जीन /एस के जैविक और पैथोफिजियोलॉजिकल भूमिका समझने की है जो फंगल पैथोजेंस को नियंत्रित करती है| हमारा परम उद्देश्य सुधार कवक सहिष्णुता के साथ ट्रांसजेनिक फसलों के विकास के लिए कुछ नए जीन का उपयोग करना है| |
हमारे शोध का एक तीसरा क्षेत्र फल नरमी (फ्रूट सोफ्टेनिंग) के विनियमन के रूप में टमाटर का उपयोग कर एक मॉडल प्रणाली की जांच करना है| हम फलों और सब्जियों के शैल्फ जीवन को बढ़ाने में रुचि रखते हैं, क्योंकि फल नरमी में देरी ही अपने नुक़सान को नियंत्रित करने के लिए प्रमुख नियामक तंत्र है| प्रायोगिक दृष्टिकोण नरम संबंधित जीन खनन और विकासशील नॉक-आउट ट्रांसजेनिक प्लांट्स को उम्मीदवार जीनों (कैंडीडेट् जींस) के लिए शामिल करता हैं|
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| हमारी प्रयोगशाला में मोलिक्यूलर बायोलोजी, बायोकेमिस्ट्री, माइक्रोएरे, प्रोटिओमिक टेक्नोलोजी, कम्प्यूटेशनल जीव विज्ञान और जेनेटिक ट्रांस फोर्मेशन को उपकरण के रूप में प्रयोग करते है| |
| चयनित प्रकाशन |
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Chattopadhyay A, Subba P, Pandey A, Bhushan D, Kumar R, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2011) Analysis of the grasspea proteome and identification of stress-responsive proteins upon exposure to high salinity, low temperature and abscisic acid treatment. Phytochemistry 72: 1293-1307. |
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Bhushan D, Jaiswal DK, Ray D, Basu D, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2011) Dehydration-responsive reversible and irreversible changes in the extracellular matrix: comparative proteomics of chickpea genotypes with contrasting tolerance. J. Proteome Res. 10:2027-2046. |
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Ghosh S, Meli VS, Kumar A, Thakur A, Chakraborty N, Chakraborty S and Datta A (2011) The N-glycan processing enzymes α-mannosidase and β-D-N-acetylhexosaminidase are involved in ripening-associated softening in the non-climacteric fruits of capsicum. J. Exp. Bot. 62: 571-582. |
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Pandey A, Rajamani U, Verma J, Subba P, Chakraborty N, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2010) Identification of extracellular matrix proteins of rice (Oryza sativa L.) involved in dehydration-responsive network: a proteomic approach. J. Proteome Res. 9: 3443-3464. |
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Meli VS, Ghosh S, Prabha TN, Chakraborty N, Chakraborty S and Datta A (2010) Enhancement of fruit shelf life by suppressing N-glycan processing enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 2413-2418. |
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Ashraf N, Ghai D, Barman P, Basu S, Nagaraju G, Mondol MK, Chakraborty N, Datta A and Chakraborty S (2009) Comparative analyses of genotype-dependent expressed sequence tags and stress-responsive transcriptome of chickpea wilt illustrates predicted and unexpected genes and novel regulators of plant immunity. BMC Genomics 10: 415. |
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Chaudhary MK, Basu D, Datta A, Chakraborty N and Chakraborty S (2009) Dehydration-responsive nuclear proteome of rice (Oryza sativa L.) illustrates protein network, novel regulators of cellular adaptation and evolutionary perspective. Mol. Cell. Proteomics 8: 1579-1598. |
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Chakraborty S, Pandey A, Datta A and Chakraborty N (2008) Nucleus. In: Plant Proteomics: Technology, Strategies, and Applications, eds. G.K. Agrawal and R. Rakwal, John Wiley & Sons, Inc., pp.327-338. |
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Pandey A, Chakraborty S, Datta A and Chakraborty N (2008) Proteomics approach to identify dehydration responsive nuclear proteins from chickpea (Cicer arietinum L.). Mol Cell Prot 7: 88-107. |
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Bhushan D, Pandey A, Choudhary MK, Datta A, Chakraborty S and Chakraborty N (2007) Comparative proteomics analysis of differentially expressed proteins in chickpea extracellular matrix during dehydration stress. Mol Cell Prot 6: 1868 -1884. |
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Pandey A, Choudhary MK, Bhushan D, Chattopadhyay A, Chakraborty S, Datta A and Chakraborty N (2006) The nuclear proteome of chickpea (Cicer arietinum L.) reveals predicted and unexpected proteins. J. Proteome Res. 5: 3301-3311. |
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Bhushan D, Pandey A, Chattopadhyay A, Choudhary MK, Chakraborty S, Datta A and Chakraborty N (2006) Extracellular matrix proteome of chickpea (Cicer arietinum) illustrates pathway abundance, novel protein functions and evolutionary perspect. J. Proteome Res. 5: 1711-1720. |
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Chakraborty N, Datta A and Chakraborty S (2003) Nutritional Genomics: quest for GM crops for better nutrtion. Everyman's Science. (2003) 38(8): 41-43. |
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Chakraborty S, Chakraborty N, Jain D, Salunke DM and Datta A (2002) Active site geometry of oxalate decarboxylase from Flammulina velutipes: Role of histidine coordinated manganese in substrate recognition. Protein Sci. 11: 2138-2147. |
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Azam M, Kesarwani M, Chakraborty S, Natarajan K and Datta A (2002) Cloning and characterization of 5'-flanking region of oxalate decarboxylase gene from Flammulina velutipes. Biochem J. 276: 66-75. |
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Chakraborty S, Sarmah B, Chakraborty N and Datta A (2002) Premature termination of RNA polymerase II mediated transcription of a seed protein gene in Schizosaccharomyces pombe. Nuclei Acids. Res. 30: 2940-2949. |
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Sarmah B, Chakraborty N, Chakraborty S and Datta A (2002) Plant pre-mRNA splicing in fission yeast, Schizosaccharomyces pombe. Biochem. Biophy. Res.Commn. 293: 1209-1216. |
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Chakarborty S, Chakarborty N and Dutta A (2000) Increased nutritive value of transgenic potato by expressing a nonallergenic seed albumin gene from Amaranthus hypochondriacus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97: 3724-3729. |
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| पेटेंट |
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Polynucleotide sequence of fruit softening associated α-mannosidase and its uses for enhancing fruit shelf life. [IPA-1647/DEL/2008] |
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Polynucleotide sequence of fruit softening associated β-D-N-acetylhexosaminidase and its uses for enhancing fruit shelf life. [IPA-1647/DEL/2008] |
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Polynucleotide sequence of fruit softening associated α-mannosidase and its uses for enhancing fruit shelf life [PCT/IN2009/000387]. |
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Polynucleotide sequence of fruit softening associated β-D-N-acetyhexosaminidase and its uses for enhancing fruit shelf life [PCT/IN2009/000388]. |
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Seed storage protein With nutritionally balanced amino acid composition (US Patent No. 5,670,635,1997) |
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Method of making seed specific DNA (US Patent No. 5,846,736,1998) |
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