डा. सुदीप चट्टोपाध्याय
    एफएनए, एफएएससी, एफ एन ए एस सी., रामन्ना फेलो
    स्टाफ साइंटिस्ट VI (प्रोफेसर)
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 अनुसंधान क्षेत्र
प्रकाश एक पौधे की वृद्धि और विकास के लिए सबसे महत्वपूर्ण कारकों में से एक है, प्रकाश संकेत और अन्य कैसकेडस् संकेत के साथ पार वार्ता करने के लिए सुलझाना शुरू कर दिया| आरबिडोपसिस प्रतिरोपण का विकास प्रकाश की उपस्थिति अनुपस्थिति पर निर्भर करता है: स्कोटोमॉरफोजेनेसिस या अंधेरे में पीला करना और फोटोमॉरफोजेनेसिस या प्रकाश में डिटियोलेशन|  प्रकाश कई फोटोरिसेप्टर्स द्वारा माना जाता है: फाइटोक्रोम्स द्वारा रेड लाइट एवं फार रेड लाइट ( पी एचवाईए पी एचवाईई) और नीले और यूवी प्रकाश क्रिप्टोक्रोम्स द्वारा (सी.आर.वाई1 सी.आर.वाई1, और सी.आर.वाई3). फोटोरिसेप्टर्स के कार्यात्मक भूमिका और जल्दी संकेत घटकों (अर्ली सिग्नलिंग कम्पोनेंट्स) की पहचान का निर्धारण करने में एक महत्वपूर्ण प्रगति हासिल की गई है| हालांकि, फोटोरिसेप्टर्स द्वारा संकेत ट्रांसडक्सन अनुप्रवाह से नीचे की ओर प्रतिलेखन कारक अस्पष्ट बनी हुई है|
हम प्रकाश संकेतन रास्ते में जेड बॉक्स विशिष्ट प्रतिलेखन कारकों की जांच कर रहे हैं| जब हमारी प्रयोगशाला में Z-बॉक्स और उसके संबंधित प्रतिलेखन कारकों की जांच शुरू की गई, तब व्यावहारिक रूप से जेड-बॉक्स और पौधों में इसके विनियमन के बारे में कुछ नहीं जाना जाता था| हमने यह  सफल  प्रदर्शन किया हैं की जेड बॉक्स बाइंडिंग कारक (जेड.बी.एफ) पौधों में मौजूद हैं और पौधों की वृद्धि और विकास में सहायक हैं. लिगेंड बाध्यकारी स्क्रीन द्वारा जेड बॉक्स का उपयोग कर हमने कई प्रतिलेखन कारकों को क्लोन किया है| कई ऐसे जेड-बॉक्स बाइंडिंग कारकों का कार्यात्मक लक्षण वर्णन किया गया है. उदाहरण के लिए, जेड.बी. एफ1/एम.वाई.सी2 के कार्यात्मक लक्षण वर्णन (एक प्रतिलेखन कारक) से पता चलता है कि फोटोमॉरफोजेनिक विकास का एक नकारात्मक नियामक के रूप में जेड.बी.एफ1 कार्य करता है, तथापि फ्लावरिंग  टाइम में एक सकारात्मक नियामक और पार्श्व रूट गठन के रूप में कार्य करता है| इसके अलावा, जेड.बी.एफ1 पौधों में पहली प्रतिलेखन कारक है जिसने प्रकाश के बीच में पार बात को एक बिंदु के रूप में दिखाया, (अब्स्सिसिक एसिड) ए.बी.ए. और जावेद (जस्मोनिक एसिड) रास्ते संकेतन| हमने अन्य प्रकाश संकेतन घटकों के साथ आनुवंशिक (जेनेटिक) और आण्विक (मोलेकुलर) जेड.बी.एफ1 की जांच की है| जीनोम वाइड ट्रांसक्रिपशनल रूपरेखा(डीएनए) जेड.बी.एफ1 सी.ओ.पी1 डबल म्यूटेंट के आगे कि सी.ओ.पी1 और जेड.बी.एफ1/एम.वाई.सी2 विनियामक प्रकाश में शामिल जीनों की एक विस्तृत श्रृंखला की अभिव्यक्ति की विनियमितता को दर्शाता है, अनेक तनावों और विभिन्न चयापचय मार्ग. जेड.बी.एफ2/जी.बी.एफ1 की आणविक स्तर पर विशेषता (एक बीजेड.आईपी प्रतिलेखन कारक) से पता चलता है कि जेड.बी.एफ2 विभिन्न प्रकार से पौधों की वृद्धि और विकास को विनियमित और ए.बी.ए. रूट विकास, फूल समय और जवाबदेही को बढ़ावा देता है| आगे की जांच पड़ताल से पता चला है कि जेड.बी.एफ2/जीबीएफ 1 प्रोटीन कम अंधेरे में प्रचुर मात्रा में है, और एक एंटीबॉडी की मध्यस्थता सी.ओ.पी1, फोटोमॉरफोजेनेसिस के नकारात्मक नियामकों के स्वतंत्र मार्ग से पदावनत है| सी.ओ.पी1  जेड.बी.एफ2 से फिसिकली इंटरएक्ट करता हैं और जेड.बी.एफ2 प्रोटीन के इष्टतम संचय के लिए आवश्यक होता हैं|
चट्टोपाध्याय-प्रयोगशाला
 चयनित प्रकाशन
Mallappa C, Singh A, Ram H and Chattopadhyay S (2008) GBF1, a transcription factor of blue light signalling in Arabidopsis, is degraded in the dark by a proteasome-mediated pathway independent of Cop1 and SPA 1. Journal of Biological Chemistry 283: 35772-35782.
Kushwaha R, Singh A and Chattopadhyay S (2008) Calmodulin 7 plays an important roles as transcription regulator in Arabidopsis seedling development. Plant Cell 20: 1747-1759.
Bhatia S, Gangappa SN, Kuswaha R, Kundu S and Chattopadhyay S (2008) SHORT HYPOCOTYL IN WHITE LIGHT1, a Serine-Arginine-Aspartate-Rich protein in Arabidopsis, acts as a negative regulator of photomorphogenic growth. Plant Physiology 147: 169-178.
Bhatia S, Gangappa SN and Chattopadhyay S (2008) SHW1, a common regulator of abscisic acid (ABA) and light signaling pathways. Plant Signaling & Behavior 3: 1-3.
Mallappa C, Yadav V, Negi P and Chattopadhyay S (2006) A basic Leucine Zipper transcription factor, G-box-binding Factor 1, regulates blue light-mediated photomorphogenic growth in Arabidopsis. Journal of Biological Chemistry 281: 22190-22199.
Yadav V, Chandrashekara M, Sreeramaiah NG, Bhatia S and Chattopadhyay S (2005) A basic helix-loop- helix transcription factor in Arabidopsis, MYC2, acts as a repressor of blue light-mediate photomorphogenic growth. Plant Cell 17: 1953-1966.
Hettiarachchi GHCM, Yadav V, Reddy MK and Chattopadhyay S (2005) Regulation of TOP2 by various abiotic stresses including cold and salinity in pea and transgenic tobacco plants. Plant Cell Physiol. 46: 1154-1160.
Hettiarachchi GHCM, Yadav V, Reddy MK, Chattopadhyay S and Sopory SK (2003) Light mediated regulation defines a minimal promoter region of TOP2. Nucleic Acids Research 31: 5256-5265.
Yadav V, Kundu S, Chattopadhyay D, Negi P, Wei N, Deng XW and Chattopadhyay S (2002). Light regulated modulation of Z-box containing promoters by photoreceptor and downstream regulatory components, COP1 and HY5, in Arabidopsis thaliana. Plant Journal 31: 741-753.