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डॉ. स्वरुप के. परिदा
स्टाफ वैज्ञानिक II
पीएच.डी. - बायोटेक्नोलोजी, जामिया हमदर्द यूनीवर्सिटी,न्यू दिल्ली
पोस्ट डोक्टोरल फेलो, नेशनल रिसर्च सेंटर औन प्लांट बायोटेक्नोलोजी (NRCPB),न्यू दिल्ली
दूरभाष: 91-11-26741612, 14, 17 एक्सटेंशन: 228
सीधा संपर्क: 91-11-26735228
फैक्स: 91-11-26741658
ई-मेल: swarup@nipgr.res.in; swarupdbt@gmail.com |
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 करियर |
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स्टाफ वैज्ञानिक II - नॅशनल इंस्टिट्यूट ऑफ़ प्लांट जेनोम रिसर्च (NIPGR), न्यू दिल्ली (2011 औनवर्ड्स) |
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पोस्ट डोक्टोरल फेलो, नेशनल रिसर्च सेंटर औन प्लांट बायोटेक्नोलोजी (NRCPB), न्यू दिल्ली (2010 -11) |
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पी.एच. डी. - बायोटेक्नोलोजी, जामिया हमदर्द यूनीवर्सिटी, न्यू दिल्ली (2006-10) |
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सीनिअर रिसर्च फेलो, नेशनल रिसर्च सेंटर औन प्लांट बायोटेक्नोलोजी (NRCPB), न्यू दिल्ली (2004 -09) |
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एम्.एस.सी. (एग्रीकल्चरल बायोटेक्नोलोजी), इंदिरा गाँधी एग्रीकल्चरल यूनीवर्सिटी (IGAU), रायपुर, छत्तीसगढ़ (2001-03) |
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बी.एस.सी. (एग्रीकल्चर), उड़ीसा यूनीवर्सिटी ऑफ़ एग्रीकल्चर एंड टेक्नोलोजी (OUAT), भुवनेश्वर, उड़ीसा (1997-2001) |
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| पुरस्कार और फेलोशिप |
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इंडियन नेशनल साइंस अकैडमी (NASI) - यंग साइंटिस्ट प्लेटिनम जुबिली अवार्ड (2011) |
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इंडियन नेशनल साइंस अकैडमी (INSA) - यंग साइंटिस्ट अवार्ड (2010) |
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जूनिअर एंड सीनिअर रिसर्च फैलोशिप फ्रॉम सीएसआईआर (2003-04) |
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CEEB-JNU फैलोशिप फ्रॉम DBT ड्यूरिंग एम्.एस.सी. (एग्रीकल्चरल बायोटेक्नोलोजी) (2001-03) |
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OUAT मेरिट स्कोलरशिप फ्रॉम गवर्नमेंट ऑफ़ उड़ीसा ड्यूरिंग बी.एस.सी. (एग्रीकल्चर) (1997-2001) |
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NRTS मेरिट स्कोलरशिप फ्रॉम गवर्नमेंट ऑफ़ इंडिया (1992-96) |
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| अनुसंधान क्षेत्र |
| प्लांट मोलेकुलर जेनेटिक्स एंड जेनोमिक्स |
| अनुसंधान रुचि |
| जेनोमिक्स ऑफ़ सीड एंड पॉड ट्रेट्स इन चिकपी |
(फल) फली और बीज चिकपी के परिभाषित विशेषताएँ है और मानव आहार में सबसे महत्वपूर्ण और उच्च आर्थिक मूल्य के हैं| बीज और फली भी चिकपी की उपज में मुख्य योगदान के लक्षण है और व्यापक रूप से काबुली प्रकारों के बीच तथा कलटिवेटेड देसी, landrace और जंगली प्रजातियों परिग्रहण के बीच भिन्न है| संकीर्ण आनुवंशिक आधार और कलटिवेटेड चिकपी प्रजातियों में अपेक्षित आनुवंशिक परिवर्तन की कमी जीन की पहचान और ठीक मानचित्रण के लिए मुख्य सीमित कारक है जो की चना में उच्चतर फली और बीज उपज के लक्षण है| आण्विक विश्लेषण और चिकपी के उपलब्ध विविध आनुवंशिक संसाधनों के लक्षण वर्णन के साथ बीज और फली की पर्याप्त विशेषता भिन्नता है जैसे की नई पीढ़ी के जीनोमिक्स उपकरण और आधुनिक जैव सूचना विज्ञान के दृष्टिकोण का उपयोग कर पर्याप्त संख्या में सूचनात्मक आनुवंशिक मार्करों की खोज में single nucleotide polymorphisms (SNPs) और टार्गेट जीन्स और उनके विनियामक अनुक्रम में नए उपयोगी जेनेटिक तत्व प्रयोग कर तेजी ला सकते हैं| इसके अलावा, इन कैंडीडेट जीन आधारित जेनोटाईपिक जानकारी के साथ परस्पर विरोधी प्रकार की विशिष्ट बीज और फली के लक्षण की प्ररूपी जानकारी एक आकर्षक समाधान होगा - जीन्स और जेनेटिक तत्व की पहचान के लिए जो की उच्चतर बीज और चिकपी में फली उपज के सहायिक लक्षण हैं| इसके अलावा, जिन जीन और एलेलेस की पहचान आनुवंशिक संघ विश्लेषण के अंतर्गत अभिव्यक्ति की रूपरेखा तथा कार्यात्मक विश्लेषण के माध्यम से चिकपी जर्मप्लाज्म की विषम लाइनों तथा बाई-पेरेंटल मैपिंग पोपुलेशन एवं फली तथा बीज के विभिन्न विकासात्मक चरणों में की गई हैं, उनके सत्यापन से प्रमुख फली तथा बीज लक्षण के नए कार्यात्मक प्रासंगिक जीन तथा एलेलेस की पहचान की गई हैं और अन्य मल्टी सीडेड / पौडेड प्रजातियां जैसे की विग्ना के बीज एवं फली के विकास की प्रक्रिया के दौरान उनके ट्रांसक्रिप्शंल विनियमन को समझने में सक्षमता प्रदान की|
उपरोक्त को देखते हुए, अनुसंधान कार्य निम्नलिखित कारणों के लिए शुरू किया जाएगा:-
1) आईडेंटिफिकेशन ऑफ़ जीन्स एंड नोवेल ऐलेलेस फॉर ट्रेट्स कंट्रीब्युटिंग टू हाइअर सीड एंड पॉड यील्ड इन चिकपी थ्रू कैंडीडेट जीन बेस्ड
ऐसोसीएशन ऐनालिसिस एंड जीन एक्सप्रेशन प्रोफाइलिंग
2) फंक्शनल वैलिडेशन ऑफ़ द आईडेंटिफाइड जीन्स/ऐलेलेस इन ट्रांसजेनिक सिस्टम्स
3) कॉम्बीनेशन एंड यूस ऑफ़ द आईडेंटिफाइड जीन्स/ऐलेलेस इन जेनेटिक एनहैन्स्मेंट ऑफ़ टार्गेट स्पीशीस
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| Significant Research Contributions |
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Developed two new concepts "UGMS" (UniGene derived MicroSatellite) and "GNMS" (Genic Non-coding MicroSatellite) and designed novel sequence-based robust 25,318 genic and 19,281 genomic microsatellite markers in five cereal species (rice, wheat, maize, sorghum and barley) as well as in sugarcane and Brassica having large and complex genomes (NCBI Probe Database Pr009692824 to Pr009709837 and Pr010260597 to Pr010261911) for which very little sequence information is available. |
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Utilized these microsatellite markers for high-throughput genotyping, DNA fingerprinting for germplasm characterization and variety identification, developing molecular Bar Codes of commercially important Indian Basmati rice varieties, marker-based testing of seed purity of male-sterile line in rice hybrid seed production, studying genetic diversity pattern and phylogenetic relationships, construction of genic microsatellite marker-based framework physical map of rice genome and bin-map of wheat genome and genomic microsatellite marker-based Indian mustard genome map for the first-time, comparative genome mapping for understanding genome structure and evolution, development of genic functional markers for fertility restoration and mapping a major locus for male fertility restoration in rice. |
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Detected and validated the SNPs and InDels in important sugar pathway and disease resistance genes through cloned amplicons sequencing and DHPLC analysis and using a cost-efficient CAPS genotyping assay and developed CAPS markers which can be of immense use for various marker-assisted genetic improvement of sugar content and disease resistance in sugarcane. Identified a large number of SNPs and InDels in coding and regulatory sequence components of stress-responsive rice genes by whole genome resequencing and transcriptome sequencing of commercially important Indian rice varieties. Demonstrated large-scale validation and high-throughput genotyping of these SNPs from stress-responsive rice genes in a set of domesticated rice cultivars and wild species accessions using the Illumina GoldenGate assay and utilized large number of such validated useful SNP alleles/haplotypes for candidate-gene based association analysis of important stress-tolerance traits in rice. (Read more......) |
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| चयनित प्रकाशन |
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Parida SK, Mukerji M, Singh AK, Singh NK and Mohapatra T (2011) SNPs in stress responsive rice genes: validation and genotyping using Illumina GoldenGate assay. Theoretical and Applied Genetics. (In Press). |
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Parida SK, Kalia SK, Kaul S, Dalal V, Pandit A, Gaikwad K, Sharma TR, Srivastava PS, Singh NK and Mohapatra T (2011) Development of CAPS markers for SNPs in important sugar pathway and disease resistance genes of sugarcane. Molecular Genetics and Genomics. (In Press). |
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Bharathi LK, Parida SK*, Munshi AD, Behera TK, Raman KV and Mohapatra T (2011)Molecular diversity and phylogeny of Momordica spp. of Indian occurrence. Genetic Resources and Crop Evolution.(In Press) (*As joint first author). |
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Parida SK, Pandit A, Gaikwad K, Sharma TR, Srivastava PS, Singh NK and Mohapatra T (2010). Functionally relevant microsatellites in sugarcane unigenes. BMC Plant Biology 10: 251. (Highly Accessed: More than 2,500 times during one month of being on-line). |
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Parida SK, Yadava DK and Mohapatra T (2010). Microsatellites in Brassica unigenes: Relative abundance, marker design and use in comparative physical mapping and genome analysis. Genome 53: 55-67. (No. of citations: 13). |
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Parida SK, Dalal V, Singh NK and Mohapatra T (2009) Genic non-coding microsatellites in the rice genome: characterization, marker design and use in assessing genetic and evolutionary relationships among domesticated groups. BMC Genomics 10: 140. (No. of citations: 10; Highly Accessed: More than 3,500 times during three months of being on-line). |
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Parida SK, Kalia SK, Kaul S, Dalal V, Hemaprabha G, Selvi A, Pandit A, Singh A, Gaikwad K, Sharma TR, Srivastava PS, Singh NK and Mohapatra T (2009) Informative genomic microsatellite markers for efficient genotyping applications in sugarcane. Theoretical and Applied Genetics 118: 327-338. (No. of citations: 10). |
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Parida SK, Raj Kumar KA, Dalal V, Singh NK and Mohapatra T (2006) Unigene derived microsatellite markers for the cereal genomes. Theoretical and Applied Genetics 112: 808-817. (No. of citations: 56; A Most Viewed and Highly Accessed article during three months of being on-line). |
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Umakanta N, Parida SK*, Dey SK, Raj Kumar KA, Singh AK, Singh NK and Mohapatra T (2010). Genic markers for WA cytoplasm based male sterility and its fertility restoration in rice. Molecular Breeding 26: 275-292. (*As joint first author) (No. of citations: 4). |
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Yadava DK, Parida SK, Dwivedi VK, Varshney A, Ghazi IA, Sujata V and Mohapatra T (2009). Cross-transferability and polymorphic potential of genomic STMS markers of Brassica species. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 18: 29-36. (No. of citations: 8). |
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Koundal V, Parida SK, Yadava DK, Ali A, Koundal KR and Mohapatra T (2008). Evaluation of microsatellite markers for Genome mapping in Indian Mustard (Brassica juncea L.). Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 17: 69-72. (No. of citations: 6). |
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Verma VK, Behera TK, Munshi AD, Parida SK and Mohapatra T (2007). Genetic diversity of ash gourd [(Benincasa hispida (Thunb.) Cogn.] inbred lines based on RAPD and ISSR markers and their hybrid performance. Scientia Horticulturae 113: 231-237. (No. of citations: 22). |
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Naik PK, Alam MA, Singh H, Goyal V, Parida SK, Kalia S and Mohapatra T (2010) Assessment of genetic diversity through RAPD, ISSR and AFLP markers in Podophyllum hexandrum: a medicinal herb from the Northwestern Himalayan region. Physiology and Molecular Biology of Plants 16: 1-13. (No. of citations: 4). |
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Sonah H, Desmukh R, Parida SK and Kotasthane A (2009) Morphological and genetic variation among different isolates of Magnaporthe grisea collected from Chhattisgarh. Indian Phytopathology 62: 469-477. (No. of citation: 1). |
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| पुस्तक अध्याय |
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Parida SK and Mohapatra T (2010) Whole Genome Sequencing. In: Kole C, Abbott AG (Eds) Principles and Practices of Plant Genomics, Vol 3, Advanced Genomics, Science Publishers, Inc, New Hampshire and Edenbridge Ltd, British Isles, pp 120-174. |
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