संस्थान में पीएच.डी. कार्यक्रम प्रत्येक वर्ष आरम्भ किया जाता है| यह संस्थान का एक लंबे समय का प्रशिक्षण कार्यक्रम है, इस कार्यक्रम के उपरांत जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय, नई दिल्ली द्वारा पी.एच.डी. की उपाधि प्रदान की जाती है, इसके अतिरिक्त छात्रों को अन्य संस्थानों के पात्र वैज्ञानिकों के साथ संस्थान द्वारा आयोजित अल्पकालिक प्रशिक्षण कार्यक्रमों मे भाग लेने का  अवसर प्रदान किया जाता है| विद्वानों की भर्ती (जो सीएसआईआर / यूजीसी / डीबीटी / आईसीएमआर परीक्षा के जेआरएफ है)  राष्ट्रीय स्तर पर आए अनेको आवेदन  पत्रों मे से प्रतिस्पर्धा और साक्षात्कार  के आधार पर की जाती हैं| चयनित विद्वानों को पहले छह महीने पाठ्यक्रम  कार्य करने के उपरांत संयंत्र जीवविज्ञान के विभिन्न क्षेत्रों पर विभिन्न प्रयोगशालाओं में शोध कार्य किया जाता है|